The Vip nomenclature

Since the vegetatively expressed, and secreted, VIP proteins were first reported in the mid 1990s the rate of discovery of related toxins has increased in a similar fashion to that seen with the Cry toxins a decade previously. Given that each discovering lab are adopting their own naming systems for these toxins the idea was recently put forward that a nomenclature system, along the same lines used for the Cry and Cyt toxins, be adopted. On this web page we present the results of applying the Bt Cry toxin nomenclature analyses to the Vip and Vip-related toxins. The following table shows the proposed names for these toxins that result from such an analyses.

Vip1Aa1     Warren et al
1998
US 5770696 June 1998 AB78  
Vip1Aa2 PS177C8 Mis AAR81088 Feitelson et al
1999
US 6656908  Dec 2003 Bt PS177C8 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip1Aa3   GU992203 Xiumei Yu et al 2010   Bt 376  
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Vip1Ab1 Vip1Ab   Warren et al
1998
US 5770696 June 1998 Btt  
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Vip1Ac1   HM439098 Xiumei Yu
2010
     
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Vip1Ad1   AGC08395 Yang Bi et al 2013   Bt HF-18  
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Vip1Ba1 MB438 Mis (Blat 784D) AAR40886 Schnepf et al
2000
US  6605701 Aug 2003 B lat MB438 WO0009697(A2,A3) 24Feb 2000
Vip1Ba2 ISP1B CAI43278 Van Rie 2005   B laterosporus  
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Vip1Bb1 PS31F2 Mis AAR40282 Feitelson et al
1999
US 6656908  Dec 2003 Bt PS31F2 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip1Bb2 Vip1062b HM485584 Ming Sun        
Vip1Bb3 Vip1_V-J20.2 KR065727 Gomis et al 2015      
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Vip1Bc1   HM485583 Sun Ming 2010      
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Vip1Ca1 Vip1Ac AAO86514 Shi et al
2003
unpublished HD201  
Vip1Ca2 Vip_V-54.26 KR065725 Gomis et al 2015      
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Vip1Da1 ISP1A CAI40767 Boets et al
2004
US 6706860 Mar 2004    
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Vip2Aa1 Vip2Aa 1QS1A Warren et al
1998
US 5770696 June 1998 AB78  
Vip2Aa2 PS177C8 War AAR81096 Feitelson et al
1999
US 6656908  Dec 2003 Bt PS177C8 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip2Aa3   HM439097 Xiumei Yu 2010   Bt 376  
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Vip2Ab1 Vip2Ab   Warren et al
2000
US 6066783 May 2000 Btt  
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Vip2Ac1 Vip2Ac AAO86513 Shi et al
2003
unpublished HD201  
Vip2Ac2 Vip2_V-54.26 KR065726 Gomis et al 2015      
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Vip2Ad1 ISP2A CAI40768 Boets et al
2004
US 6706860 Mar2004    
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Vip2Ae1   EF442245 Basu et al 2007 unpublished Bt  
Vip2Ae2   ACH42758 Roopadevi et al 2009 unpublished Bt HD8  
Vip2Ae3   HM439099 Xiumei Yu 2010 unpublished Bc 84  
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Vip2Af1   ACH42759 Roopadevi et al 2008 unpublished Bt HD525  
Vip2Af2   EU909204 Roopadevi et al 2008 unpublished Bt HD8  
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Vip2Ag1   AGC08396 Yang Bi et al 2013   Bt HF-18  
Vip2Ag2   KC951878 Gardenia 2013   Bt Q52-7  
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Vip2Ba1 MB438 War (Blat451D) AAR40887 Schnepf et al
1999
US 6605701 Aug2003 B lat MB438 WO0009697(A2,A3) 24Feb 2000
Vip2Ba2 ISP2B CAI43279 Van Rie et al
2005
  B laterosporus  
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Vip2Bb1 PS31F2 War   Feitelson et al
1999
US 6656908 Dec 2003 Bt PS31F2 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip2Bb2   HM485585 Sun et al 2010   Sbt106  
Vip2Bb3   KJ868170 Palma et al 2014   Bt tolworthy Na205-3  
Vip2Bb4 Vip2_V-J20.2 KR065728 Gomis et al 2015      
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Vip3Aa1 Vip3Aa AAC37036 Estruch et al
1996
PNAS 93, 5389-5394 AB88  
Vip3Aa2 Vip3Ab AAC37037 Estruch et al
1996
PNAS 93, 5389-5394 AB424  
Vip3Aa3 Vip3Ac   Estruch et al
2000
US 6137033 Oct 2000    
Vip3Aa4 PS36A Sup AAR81079 Feitelson et al
1998
US 6656908 Dec 2003 Bt PS36A WO9818932(A2,A3) 7 May 1998
Vip3Aa5 PS81F Sup AAR81080 Feitelson et al
1998
US 6656908 Dec 2003 Bt PS81F WO9818932(A2,A3) 7 May 1998
Vip3Aa6 Jav90 Sup AAR81081 Feitelson et al
1998
US 6656908 Dec 2003 Bt WO9818932(A2,A3) 7 May 1998
Vip3Aa7 Vip83 AAK95326 Cai et al
2001
unpublished Bt YBT-833  
Vip3Aa8 Vip3A AAK97481 Loguercio et al
2001
unpublished Bt HD125  
Vip3Aa9 VipS CAA76665 Selvapandiyan et al
2001
unpublished Bt A13  
Vip3Aa10 Vip3V AAN60738 Doss et al
2002
Protein Expr. Purif. 26, 82-88 Bt  
Vip3Aa11 Vip3A AAR36859 Liu et al
2003
unpublished Bt C9  
Vip3Aa12 Vip3A-WB5 AAM22456 Wu and Guan
2003
unpublished Bt  
Vip3Aa13 Vip3A AAL69542 Chen et al
2002
Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao 18, 687-692 Bt S184  
Vip3Aa14 Vip AAQ12340 Polumetla et al
2003
unpublished Bt tolworthi  
Vip3Aa15 Vip3A AAP51131 Wu et al
2004
unpublished Bt WB50  
Vip3Aa16 Vip3LB AAW65132 Mesrati et al 2005 FEMS Micro Lett 244, 353-358 Bt  
Vip3Aa17 Jav90   Feitelson et al 1999 US 6603063 Aug 2003 Javelin 1990 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip3Aa18   AAX49395 Cai and Xiao 2005 unpublished Bt 9816C  
Vip3Aa19.0 Vip3ALD DQ241674 Liu et al 2006 unpublished Bt AL  
Vip3Aa19 Vip3A-1 DQ539887 Hart et al 2006 unpublished    
Vip3Aa20 Vip3A-2 DQ539888 Hart et al 2006 unpublished    
Vip3Aa21 Vip ABD84410 Panbangred 2006 unpublished Bt aizawai  
Vip3Aa22 Vip3A-LS1 AAY41427 Lu et al 2005 unpublished Bt LS1  
Vip3Aa23 Vip3A-LS8 AAY41428 Lu et al 2005 unpublished Bt LS8  
Vip3Aa24   BI 880913 Song et al 2007 unpublished Bt WZ-7  
Vip3Aa25   EF608501 Hsieh et al 2007 unpublished    
Vip3Aa26   EU294496 Shen and Guo 2007 unpublished Bt TF9  
Vip3Aa27   EU332167 Shen and Guo 2007 unpublished Bt 16  
Vip3Aa28   FJ494817 Xiumei Yu 2008 unpublished Bt JF23-8  
Vip3Aa29   FJ626674 Xieumei et al 2009 unpublished Bt JF21-1  
Vip3Aa30   FJ626675 Xieumei et al 2009 unpublished MD2-1  
Vip3Aa31   FJ626676 Xieumei et al 2009 unpublished JF21-1  
Vip3Aa32   FJ626677 Xieumei et al 2009 unpublished MD2-1  
Vip3Aa33   GU073128 Diego Sauka 2009   Btk HD1  
Vip3Aa34   GU073129 Diego Sauka 2009   INTA TA24-6  
Vip3Aa35   GU733921 Audtho et al 2010 unpublished Bt M190  
Vip3Aa36   GU951510 Feng et al 2010      
Vip3Aa37   HM132041 Sauka et al 2010   Bt HD110  
Vip3Aa38   HM117632 Shu et al 2010      
Vip3Aa39   HM117631 Shu et al 2010      
Vip3Aa40   HM132042 Sauka et al 2010      
Vip3Aa41   HM132043 Sauka et al 2010      
Vip3Aa42   HQ587048 Marucci et al 2010      
Vip3Aa43   HQ594534 Marucci et al 2010      
Vip3Aa44   HQ650163 Kaur et al 2010   BCSC 4A6  
Vip3Aa45   JF710269 Palma et al 2011      
Vip3Aa46   JQ228436 Zhao Shiyuan 2011   Bt LB-73  
Vip3Aa47   JQ228435 Zhao Shiyuan 2011   Bt LS-10  
Vip3Aa48   JQ731616 Tao Liu 2012   Bt ZG151-20  
Vip3Aa49   JQ731617 Tao Liu 2012   Bt ZG162-12  
Vip3Aa50   JQ946639 Figueiredo et al 2012   Bt I131  
Vip3Aa51   KC156649 Sampson et al 2012      
Vip3Aa52   KF826718 Ying Li et al 2013      
Vip3Aa53   KF826723 Ying Li et al 2013      
Vip3Aa54   AHK23264 Binjiao Xie 2014      
Vip3Aa55   KJ868172 Palma et al 2014      
Vip3Aa56   LN624748 Padaria and Lone 2014   MTCC 5846  
Vip3Aa57   AJD18609 Lishuai Shuai 2014   Bt LS678  
Vip3Aa58   KR259139 Kaznowski et al 2015   HD1  
Vip3Aa59   KR259140 Kaznowski et al 2015   MPU B33  
Vip3Aa60   KR340473 Bo Liu et al 2015    
Vip3Aa61   KU522245 Padaria et al 2016   Bt JK37  
Vip3Aa62   KT792883 Li 2016   Bt ls2  
Vip3Aa63   KY780302 Gilani et al 2017      
Vip3Aa64   KY883694 Soonsanga et al 2017   Bt294  
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Vip3Ab1 Vip3B AAR40284 Feitelson et al
1999
US 6603063 Aug 2003 Bt KB59A4-6 WO9957282(A2,A3)  11Nov 1999
Vip3Ab2 Vip3D AAY88247 Feng and Shen 2006 unpublished Bt  
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Vip3Ac1 PS49C   Narva et al
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US application 20040128716    
.      
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Vip3Ad1 PS158C2   Narva et al
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US application 20040128716    
Vip3Ad2 ISP3B CAI43276 Van Rie et al
2005
unpublished Bt  
Vip3Ad3   KF826720 Ying Li et al 2013      
Vip3Ad4   KF826727 Ying Li et al 2013      
Vip3Ad5   KR263164 Bo Liu et al 2015   Bt-HD-0203-01  
Vip3Ad6   KU761577 Bairong Lin 2016      
.      
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Vip3Ae1 ISP3C CAI43277 Van Rie et al
2005
unpublished Bt  
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Vip3Af1 ISP3A CAI43275 Van Rie et al
2005
unpublished Bt  
Vip3Af2 Vip3C   Syngenta
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WO 03/075655    
Vip3Af3   HM117634 Shu et al 2010      
Vip3Af4   KM276664 Zonglan Yu 2014   Bt BN23-5  
.      
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Vip3Ag1 Vip3B   Syngenta
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WO 02/078437    
Vip3Ag2   FJ556803 Audtho et al 2010   Bt  
Vip3Ag3   HM117633 Shu et al 2010      
Vip3Ag4   HQ414237 Palma et al 2010      
Vip3Ag5   HQ542193 Marucci et al 2010      
Vip3Ag6   JQ397328 Palma et al 2011      
Vip3Ag7   KF826713 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag8   KF826714 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag9   KF826715 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag10   KF826716 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag11   KF826719 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag12   KF826721 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag13   KF826722 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag14   KF826725 Ying Li et al 2013      
Vip3Ag15   KF826726 Ying Li et al 2013      
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Vip3Ah1 Vip3S DQ832323 Li and Shen 2006 unpublished Bt  
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Vip3Ai1   KC156693 Sampson et al 2012      
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Vip3Aj1   KF826717 Ying Li et al 2013      
Vip3Aj2   KF826724 Ying Li et al 2013      
.              
Vip3Ba1   AAV70653 Rang et al 2004 unpublished    
Vip3Ba2   HM117635 Shu et al 2010      
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Vip3Bb1 Vip3Z   Syngenta
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WO 03/075655    
Vip3Bb2   ABO30520 Beard et al 2007      
Vip3Bb3   ADI48120 Audtho et al 2010      
               
Vip3Bc   MF543028 Zack et al 2016      
               
Vip3Ca1   ADZ46178 Palma et al 2012      
Vip3Ca2   AEE98106 Hernandez et al 2012      
Vip3Ca3   HQ876489 Maeztu et al 2011      
Vip3Ca4   JN836992 Maeztu et al 2011      
               
Vip4Aa1   HM044666 Ming Sun et al 2010   Bt Sbt009